生殖器疱疹的组织病理有如下的特征：
　　
　　表皮内水疱，系细胞的气球变性及网状变性所致，疱内可见棘层松解细胞及多核上皮巨细胞。真皮乳头水肿，可见血管外红细胞，真皮内程度不等的炎症细胞浸润，有嗜中性白细胞、淋巴细胞等。
　　
　　目前诊断生殖器疱疹主要靠病史、症状和体征。在一些有条件的大医院可做病毒分离，用免疫荧光检查病毒包涵体，电镜检查病毒颗粒，酶联免疫吸附试验或放射免疫测定检测病毒抗原。
　　
　　实验室检查
　　
　　l．细胞学检查：从疱底或溃疡面刮取少量组织作涂片，Wright-Giemsa染色或Papanicolaou染色，可检出HSV感染具特征性的多核巨细胞内的嗜酸性包涵体。但不能区别HSV感染或水痘-带状疱疹病毒感染，敏感性仅为病毒分离的60%。
　　
　　2.免疫疗法：自体活菌疫苗免疫疗法原理，采用手术切取患者自身感染HSV病毒感染细胞，将病原疣体(HSV病毒)及其代谢产物，经过人工减毒、灭活或利用基因工程等方法制成的用于治疗生殖器疱疹的自动免疫抗毒制剂。保留了病原菌刺激免疫系统抗病毒的特性。让自身免疫系统便会产生一定的保护物质，如免疫激素、活性生理物质、特殊抗体等；产生主动清除病毒能力，达到临床治疗痊愈的目的，当再次接触到这种病原菌时，人体的免疫系统便会依循其原有的记忆，制造更多的保护物质来阻止病原菌的伤害。结果临床应用5263例，少则5天,症状全部消失，不留痕迹。疗效明显而持久，术后6个月至3年随访，仅2例患者出现复发。结论特定的抗原激活自体免疫系统产生了相应的抗体从而达到治疗效果。此法安全可靠，操作简便，疗效肯定，一般治疗4-5天患者就可以出院，成为目前治疗生殖器疱疹的新型方法。
　　
　　3.抗体检测法:常用蛋白印迹法，也可用gD2作抗原检测HSV-2抗体，具有敏感性高，且能区分HSV-l和HSV-2的优点。
　　
　　4.抗原检测法:如PCR检测皮损HSV的DNA，敏感性和特异性高，能大大提高生殖器溃疡病人中HSV确诊的能力，但费用昂贵，且受操作技术和实验室条件及设备的影响，容易出现假阳性，故用于临床诊断其准确性受影响。
　　
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